梅里埃VITEK梅里埃鑒定卡是一種包含多個檢測區(qū)域,同時進行多個生化反應的特殊培養(yǎng)基鑒定系統(tǒng),它可以用來鑒定腸桿菌科,葡萄球菌,李斯特菌,鏈球菌,厭氧菌,革蘭氏陰性菌和氧化酶陽性菌等。通過在各檢測區(qū)域生化反應后不同的顏色變化組合,對照測試編碼手冊,來鑒定微生物的種類。
DNA測序進行菌種鑒定的結(jié)果比傳統(tǒng)生化鑒定更為直接,鑒定結(jié)果也更為可靠。測序不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用。對于細菌,對16SrRNA進行分析鑒定,對于真菌,對其ITS基因進行測序分析。
利用特定引物PCR擴增未知菌株的16SrRNA基因或者ITS區(qū),并進行DNA測序,與GenBank中的已知序列進行同源性比較后,判定細菌種類,將細菌劃分到屬或種。
微基生物專注微生物多樣性研究,為高校、醫(yī)院、研究所等單位提供科研服務(wù)。不僅可以檢測土壤、水體、糞便、腸道內(nèi)容物等樣本中混合微生物的種類及豐度,而且還可以提供細菌、真菌等純菌的菌種鑒定服務(wù)。
土壤、水體、糞便等樣本中的微生物一般為混合菌,需要在一定條件下通過培養(yǎng)、分離、純化后,得到純菌。對純的細菌、真菌等菌種,均可進行菌種鑒定服務(wù)。
菌種鑒定一般是提取純菌A的基因組DNA,然后PCR擴增16srDNA片段,之后通過一代測序或三代測序檢測16SrDNA的全長,與國際上的數(shù)據(jù)庫進行Blast比對,默認選取比對結(jié)果中相似性高的前位的物種分類信息,之后構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,得出樣本A與XX物種的相似性高。